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Le infezioni gastrointestinali possono essere causate da batteri, virus e parassiti e sono tra le malattie infettive più frequenti. Si manifestano con gastrite, diarrea, vomito o sintomi aspecifici che, nel caso di alcune infezioni batteriche o virali, possono manifestarsi entro poche ore dall'incontro con l‘agente patogeno. In alcuni casi poi, possono portare a sequele croniche. Le infezioni da patogeni parassitari, invece, hanno solitamente un decorso cronico.
Le infezioni virali sono spesso autolimitanti, per cui è sufficiente trattare i sintomi e di solito non vengono eseguiti esami diagnostici di laboratorio. Batteri come Yersinia e Campylobacter, tuttavia, possono causare malattie secondarie immunologicamente mediate, ad esempio l'artrite reattiva. In questo caso, i test sierologici possono supportare la diagnosi. Le infezioni da Helicobacter pylori possono causare gastrite cronica attiva e complicazioni come ulcera gastroduodenale, carcinoma gastrico o linfoma. La ricerca di anticorpi è raccomandata nei casi sospetti di infezione non acuta o cronica. Anche agenti patogeni parassitari come Schistosoma e Strongyloides stercoralis possono causare sintomi gastrointestinali con decorso cronico. Per la diagnostica si applicano metodi diretti e indiretti. In generale, la ricerca di anticorpi specifici è adatta a supportare la diagnosi nei casi sospetti di decorso cronico o di malattie secondarie, ma non per la diagnostica nei casi acuti.
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